J1939 a NMEA 2000 sú založené na protokole zbernice Controller Area Network (CAN) a zdieľajú veľa podobností, ale majú aj niektoré dôležité rozdiely.
J1939 je protokol navrhnutý pre ťažké úžitkové vozidlá a priemyselné aplikácie, zatiaľ čo NMEA 2000 je protokol navrhnutý špeciálne pre námorné aplikácie. Aj keď oba protokoly používajú rovnakú základnú technológiu zbernice CAN, existujú určité kľúčové rozdiely, pokiaľ ide o typy prenášaných údajov, typy používaných zariadení a spôsob konfigurácie sietí.
Jedným z hlavných rozdielov je spôsob, akým sú zariadenia adresované v sieti. V J1939 má každé zariadenie priradenú jedinečnú adresu, zatiaľ čo v NMEA 2000 je každému zariadeniu priradený jedinečný identifikátor na základe jeho typu a správy sa odosielajú na konkrétne typy zariadení a nie na konkrétne adresy.
Ďalším rozdielom sú typy podporovaných správ. J1939 podporuje širokú škálu typov správ pre rôzne typy údajov, zatiaľ čo NMEA 2000 sa zameriava predovšetkým na námorné údaje, ako sú navigácia, motor a údaje o počasí.
Nakoniec existujú rozdiely vo fyzických konektoroch a kabeláži použitých pre dva protokoly. J1939 zvyčajne používa konektory Deutsch a vysokovýkonnú kabeláž, zatiaľ čo NMEA 2000 používa menšie vodotesné konektory a tenšiu kabeláž určenú na použitie v námornom prostredí.
